ATG blog

Visual Guide IV - Measuring cells with ImageJ

A first "visual" guide, in this case, related to image processing is available from the blog at the ATG-website . Currently available in english, it gives some - very basic - directions on how to define regions of interest (ROI) in images from neurons (well, basically this works with any image) using ImageJ . This guide is far from complete, and surely there are much more sophisticated methods which can be applied in image processing. If you have ideas, comments, correction and/or extension, or if you have written some other directions or instructions which might be of interest to a broader audience, and which you like to provide access to via the ATG website, please contact me . Or please use the provided comment-function in the blog, to file a existing weblink.

Get the "Visual Guide IV: Measuring cells with ImageJ" here (PDF, 1.7Mb).

Visual Guide IV - Zellananalyse mit Image J

Eine erste, "visuelle Anleitung", in diesem Falle zur Bildbearbeitung mit ImageJ findet sich im Blog der ATG-Webseite . Zur Zeit nur in englischer Sprache, gibt sie einige Anleitungen, wie sich relativ komfortabel Bildbereiche in mikroskopischen Aufnahmen mittels ImageJ definieren und auswerten lassen. Diese Anleitung ist keinesfalls vollständig, und es gibt sicherlich ein Füllhorn weiterer, weitaus komplexerer Methoden die sich anwenden ließen. Falls jemand dazu Ideen, Kommentare, Korrekturen, Ergänzungen, oder aber auch andere Anleitungen besitzt, die er/sie geschrieben hat (und die via ATG-Webseite einem breiterem Publikum zugänglich gemacht werden dürfen) - kontaktiere man mich bitte. Eventuell kennen Sie ja auch weitere, zu diesem Thema passende, Dokumente im Internet - nutzen Sie doch bitte die Kommentarfunktion zu diesem Blog-Eintrag, um die entsprechenden Links dort abzulegen.

Falls Interesse an einer deutschsprachigen Version besteht, kontaktiere man mich bitte (eventuell möchte ja auch jemand dazu beitragen?).

Die PDF-Datei des "Visual Guide IV: Measuring cells with ImageJ" kann hier heruntergeladen werden (1.7Mb).